Комбинативная изменчивость возникает в процессе скрещивания. Поэтому успех в селекции в Значительной мере определяется подбором родительских пар для скрещивания, так как гибридизация — это основной способ получения новых сортов. Существует три концепции подбора родительских пар для скрещивания:

— концепция сорта — подбор для скрещивания большого числа сортов с Надеждой на получение желаемой комбинации положительных признаков. Использовалась на ранних этапах селекции, когда было малоизвестно о генетике передачи признаков. Сейчас она не находит широкого применения, так как много риска и неопределенности, большая трудоемкость и много выбраковки различных комбинаций. Успех этой концепции определяется в основном использованием большого числа комбинаций скрещиваний, хотя только некоторые могут дать перспективные сорта. В настоящее время ее используют при переходе на новую программу скрещиваний или когда у селекционера нет времени детально изучить признаки сортов, с которыми он работает;

— концепция признака — подбор родительских пар на основе знания признаков родителей, которые хотят объединить в новых сортах. При этом выбор родителей требует поиска различий между сортами в признаках, которые должны объединиться. Скрещивания базируются на большой генетической дивергентности между родителями, и у селекционера возникает возможность сокращать число комбинаций скрещиваний в сравнении с концепцией сорта. При этом если селекцию ведут методом возвратных скрещиваний, то в качестве реципиента (рекуррентного родителя) берут такого родителя, у которого большее число положительных признаков. В настоящее время эту концепцию применяют почти во всех программах создания новых сортов;

— концепция гена — подбор родительских пар для скрещивания на основе знания генетической структуры признаков, по которым ведется селекция. К сожалению, эта структура известна не для всех признаков и тем более полигенных. Например, устойчивость к стеблевой ржавчине пшеницы обусловлена более чем 15 генами, к листовой ржавчине — примерно 25 главными генами и т. д. Аналогично наследуется устойчивость к гельминтоспориозу у ячменя, кукурузы и сорго. Полигенно также наследуется продуктивность сортов, зимостойкость, засухоустойчивость, качественные показатели урожая и пр. Однако чем лучше познана генетическая основа признаков, тем натежнее можно подобрать родительские пары для скрещивания. Поэтому концепция гена должна стать ведущей в будущей селекции.

Кроме указанных выше концепций в селекции растений существует еще один принцип подбора родительских пар для скрещивания — эколого-географический, который, в частности, отстаивал и применял И. В. Мичурин. Он считал, что лучшие сорта дает скрещивание или прививка географически удаленных сортов и видов. Этот принцип успешно использовал в селекции озимой пшеницы советский академик П. П. Лукьяненко. Принцип основан на генетической дивергентности сортов, формирующихся в разных эколого-географических условиях.

При подборе пар для скрещивания в основном учитывают следующие сложные признаки:

— элементы продуктивности — определяют как число зерен на одно растение, или массу 1000 семян, или число продуктивных стеблей, или число растений на единицу площади и пр.;

— продолжительность отдельных фаз вегетации — для селекционера у сорта важна скороспелость, которая обратно связана с урожайностью.